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目的：对合肥地区2010年5～7月儿童手足口病流行期间的手足口病患儿进行病原学调查.方法：采集手足口病患儿的疱疹液、粪便、咽拭子进行病毒分离;分离的病毒接种非洲绿猴肾细胞（Vero）后待细胞病变（CPE）达到＋＋＋＋以上后提取RNA.分别用EV71和CA16的VP1基因的特异性引物进行RT-PCR鉴定,并根据血清型不同比较其临床特征.结果：77例患儿采集的标本中65例分离到病毒；经RT-PCR检测发现其中47例CA16阳性,18例为EV71,比例为2.6∶1.CA16感染和EV71感染在患者的年龄大小、症