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微晶丘主要由灰泥组成,仅见少量生物碎屑,其成因尚无圆满解释.借鉴现代海底勘查成果,依据北京西山微晶丘、白云鄂博赋矿微晶丘、腮林忽洞微晶丘的特征,认为微晶丘是海底热水(伴CO2)的化学作用产物:现代海底勘查发现的微晶丘是形成于洋中脊、热点或弧后盆地;北京西山等地的纯灰岩微晶丘是形成于大陆内部;而白云鄂博赋矿白云岩是一个大型微晶丘,形成于被动大陆边缘.微晶丘中的生物作用仅是深海热水活动的伴生作用,并不是微晶丘形成的主导作用.