随着大数据时代的到来,互联网信息技术进一步普及,内部控制的信息化建设在科学事业单位体系内迅速发展.内部控制制度逐步完善,内部控制体系日见雏形,与之相辅相成的各种信息化系统也从单一、独立的账务和报表系统,演变成了从预算控制系统、财务账务系统到各种财务报告系统的一系列信息化系统的集合.从某种意义上讲,这对科学事业单位内部控制的发展起到了相当重要的推进作用.但是,就算在信息化高速发展的今天,科学事业单位的内部控制信息化还是不可避免地存在一些问题,特别是越来越多的各类信息化系统之间虽有着千丝万缕的联系,却大多各自为战,互不相通,缺少融合,这已经成为制约科学事业单位内部控制信息化发展的关键因素.本文首先阐述什么是内部控制信息化以及内部控制信息化在科学事业单位内部控制体系中的重要地位;之后分析现阶段我国科学事业单位内部控制信息化存在的一些问题,并从内部和外部两方面进行分析和总结;最后,为改善我国科学事业单位内部控制信息化的现状,提高内部控制信息化的有效性,针对科学事业单位在内部控制信息化建设中存在的问题,提出相应的对策.