黑果枸杞bHLH转录因子家族的生物信息学分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yanjiawei2005
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植物转录因子在植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的作用。BHLH 转录因子是植物转录因子中最大的家族之一,不仅影响植物生长发育、胁迫响应,还参与调控信号转导和激素合成。本研究通过对枸杞属植物黑果枸杞的bHLH家族进行全面分析和鉴定,丰富bHLH家族在不同物种中的系统研究,为揭示该基因家族参与枸杞生长、发育尤其是果实发育的调控机制提供数据参考。结果表明,通过对注释得到的132个非冗余的黑果枸杞bHLH基因家族成员进行亚细胞定位预测,发现81个bHLH转录因子定位于细胞核中,48个定位于细胞外。黑果枸杞bHLH蛋白含2个保守结构域,碱性区含有高度保守序列His5-Glu9-Arg13,与靶DNA结合相关;螺旋区内Arg-25和Arg-55完全保守,参与二聚体形成。黑果枸杞bHLH蛋白结构域有多个氨基酸位点保守性较高,其中98个bHLH蛋白具有E-box结合功能,19个出现频率高于50%的保守位点,属于bHLH典型结构域序列特征。黑果枸杞bHLH家族含有3种保守基序,黑果枸杞bHLH基因全部成员可分为22个亚族。随着黑果枸杞果实的发育,bHLH家族基因的表达存在差异,有48个bHLH转录因子基因随果实的发育成熟呈现出表达量上调,共有41个bHLH转录因子基因随果实的发育成熟表达下调。
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