微孢子虫感染的柞蚕蛹内细菌种群分布及遗传多样性分析

来源 :西南师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：watertnt

【摘要】

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分离纯化微孢子虫感染的柞蚕蛹内单细胞微生物,采用CTAB法提取混合样品总DNA,并应用高通量SOLEXA测序技术进行测序.通过生物信息学方法进行分析比较,共鉴定了87个种,隶属于37

【作者】

：

何承民何强张小燕

【机构】

：

重庆师范大学生命科学学院

【出处】

：

西南师范大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2016年7期

【关键词】

：

柞蚕蛹细菌多样性基因组

【基金项目】

：

国家高技术研究发展计划“863”项目(2013AA102507);重庆市教委科学技术项目(KJ090813;KJ110611)

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分离纯化微孢子虫感染的柞蚕蛹内单细胞微生物,采用CTAB法提取混合样品总DNA,并应用高通量SOLEXA测序技术进行测序.通过生物信息学方法进行分析比较,共鉴定了87个种,隶属于37个属17个科的细菌,主要分布在变形杆菌属Proteus、乳球菌属Lactococcus、假单胞菌属Pseudomonas、芽孢杆菌属Bacillus、肠球菌属Enterococcus等,揭示了微孢子虫感染的柞蚕蛹内细菌种群的多样性.对细菌相关基因的COG（同源蛋白簇）注释显示,参与产能及能量代谢的基因数量所占比例最多;对蛋白序

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