咖啡驼孢锈菌ITS序列特征及系统发育关系

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为了了解咖啡驼孢锈菌ITS序列特征及系统发育关系,本研究对来自中国咖啡栽培区的咖啡驼孢锈菌ITS序列进行了克隆。将克隆序列与来自不同咖啡种植区的咖啡驼孢锈菌菌株序列多样性进行了比较,并于NCBI数据库中下载其他锈菌菌株ITS序列进行系统发育关系研究。结果表明,来自中国咖啡栽培区的咖啡驼孢锈菌ITS序列全长950 bp。其中ITS1长为224 bp,GC含量介于30.36%-31.25%之间;5.8S长为153 bp, GC含量为37.25%;ITS2长483-485 bp,GC含量介于24.12%-25.
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