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《佛说化珠保命正经》的内容是记载释迦牟尼为药王、药上二位菩萨演说痘症的来源与治疗方法，其关于出痘原因的解释及阴阳变化思想与佛教传统观念不一致，且没有其他语系的佛教经典依据，故据此可认定此经是伪经。但《药王菩萨化珠保命真经序》的确是王阳明于正德五年离开贵阳之际所作，王阳明得《佛说化珠保命真经》以及撰写序文的地点和时间与《年谱》相合，《序》中所言王阳明谪居龙场时的情景也与史实相符。通过研读该《序》及其相关资料发现，弘治末年“渐悟仙释之非”后，王阳明曾一度减少与佛教界的交往；在谪居龙场的特殊条件的刺激下，王阳明