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重点大学合并必须进行实质性合并,即实现机构政令、招生就业、学科设置、教学管理、财务管理和校区规划等六个统一.新合并的重点大学在院系调整中比较突出的是学科环境问题.从生态学的角度看,如何防止把原来各校园相近学科的专业力量相加集中于某一校园,而造成各校园(现为合并学校的各校区)变成若干新的单科性学院,即所谓的学科生态环境的'沙漠化',是合并高校学科建设的重大课题.