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牡丹连作障碍已严重危害其生长发育,根际土微生物环境可直接反映由连作障碍带来的变化,探究连作状态下不同种植年限‘凤丹’牡丹根际土微生物环境的演替规律及菌体群落多样性的变化,对‘凤丹’牡丹产业持续发展具有重要的理论意义。本研究选用Illumina高通量测序技术,对洛阳地区2年、4年、5年、10年、32年生‘凤丹’牡丹根际土菌群群落进行测序分析,研究真菌18S r DNA V5可变区的丰富度和多样性指数,测序后5组不同种植年限根际土中共得到1 069 322条Clean Reads,序列过滤拼接后可得534659条Tags;5组土壤样品共含有3 419个OTUs,涵盖了5门、17纲、18目、175科、299属、376种菌群;科水平上‘凤丹’牡丹根际土菌群中的优势菌群为:Incertae Sedis(24.90%)、Sordariomycetes(15.25%)、Sordariaceae(12.11%)、Filobasidiales(7.48%)以及Rhizophlyctidaceae(6.21%);属水平上‘凤丹’牡丹根际土菌群中的优势菌群为:Tetracladium(20.81%)、Incertae Sedis(13.98%)、Sordaria(12.12%)和Filobasidiaceae(7.48%);Alpha多样性分析和Beta多样性分析均表明,不同种植年限‘凤丹’牡丹根际土菌群群落多样性为:10年生>5年生>32年生>4年生>2年生。本研究可确定连作状态下不同种植年限对‘凤丹’牡丹根际土菌群群落有显著影响,菌群群落多样性呈先升高后降低趋势;不同种植年限中均具有特异性强的优势菌群;连作过程中Gracilipodida、Acanthocystidae和Freshwater Opisthokonta三类真菌群落随种植年限的增加才出现,这些特异性菌群可直接说明连作障碍对根际土壤真菌群落的影响。以上结果将为解析‘凤丹’牡丹连作障碍机制提供理论基础。