日本的学校卫生体系可追溯到1872年其教育体系的建立。当时的主要目的在于防止学校成为天花、霍乱等传染病的传播场所。1898年皇室颁布法令在学校设立校医,自此,校医在学校卫生中发挥了重要作用。近年来,社会环境和生活环境迅速变化,并伴随着年轻人中大量新的健康问题的出现。为了应对这些涌现出的大量问题,日本医学会采取的政策包括3种形式,即成立日本医学会学校卫生委员会、对校医进行培训、召开全国性的校医大会。目前,日本医学会与国家政府和其他相关机构通过不同的方式开展工作,如开办培训课程以普及校医应该了解的某些知识。不同医学领域专家的合作以及健康教育和健康管理活动的开展,为在校儿童一生的健康奠定了坚实的基础。近期,在尼泊尔日本还参与开展了一项全球合作项目,旨在改善发展中国家的健康水平,并取得了非常显著的成果。