日本囊对虾基因组小卫星的特征分析

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为了分析日本囊对虾基因组中小微星序列的分布特征并开发小卫星标记,构建了日本囊对虾随机基因组文库,对其中片段长度为400~1000bp的3395个克隆测序,共获得总长度为1606711bp的DNA序列。在序列拼接后的2815个克隆中,筛选到487个小卫星序列,其序列总长度占测序序列总长度的3.97%。小卫星序列中,以12bp重复单位的序列数量最多(8.62%),总体趋势表现为重复单位越长,相应的重复序列数目越少(R=-0.826,P〈0.01)。小卫星重复单位拷贝数分布范围以8bp重复单位最广(3.1~47
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