【目的】近年来，苹果病毒病的发生日趋严重，对产业的健康发展造成了严重影响，但是其在苹果新品种瑞阳、瑞雪、瑞香红上的发病状况尚不明确。【方法】本研究在2021—2022年间，采用RT-PCR方法对白水地区198份新品种样品进行病毒病检测，并对感染苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid， ASSVd）植株的果实症状进行了调查和基因克隆、测序。【结果】检测结果显示白水地区新品种潜隐性病毒的感病率显著高于非潜隐性病毒，其中苹果褪绿叶斑病毒（Apple chlorotic leaf spot virus， ACLSV）的检出率最高，达到了91.72%，其次是苹果茎沟病毒（Apple stem grooving virus， ASGV）和苹果茎痘病毒（Apple stem pitting virus， ASPV），检出率分别达到了77.16%、37.13%，苹果坏死花叶病毒（Apple necrotic mosaic virus， ApNMV）的检出率为30.31%，苹果锈果类病毒和苹果凹果类病毒（Apple dimple fruit viroid， ADFVd）的检出率接近10%；通过对新品种携带病毒类型分析发现，新品种瑞阳整体的检出率低于瑞雪和瑞香红，且73.17%植株病毒复合侵染种类以2～3种为主，而瑞雪、瑞香红57.55%、69.39%的植株以3～4种为主；3个新品种感染苹果锈果类病毒后，瑞阳主要表现为‘花脸型’，瑞雪、瑞香红表现为‘花脸型’、‘果面凹凸不平’2种症状；通过对三个新品种ASSVd分离物进行测序、分析，发现新品种瑞阳分离物与伊朗苹果分离物（KM213397.1）同属一个分支，新品种瑞雪、瑞香红分离物序列与韩国、加拿大苹果分离物（AF421195.1、X71599.1）同属一个分支。【结论】检测结果表明白水地区三个新品种苹果褪绿叶斑病毒、苹果茎沟病毒感病率较高，非潜隐性病毒的感病率相对较少，且新品种瑞阳对病毒的敏感性较低；新品种瑞雪、瑞香红的苹果锈果类病毒分离物属于同一分支，而它们拥有共同的亲本（克氏粉红×秦富1号），这从寄主亲缘关系的远近的角度表明ASSVd侵染存在寄主特异性。