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目的：探讨二氧化碳激光治疗联合5-氟尿嘧啶治疗扁平疣的临床疗效。方法：选取我院2014年12月至2015年12月收治的120例扁平疣为研究对象，将所有患者根据不同的治疗方法分为对照组和研究组，每组60例，对照组患者给予二氧化碳激光治疗，研究组在对照组的基础上联合使用5-氟尿嘧啶注射液局部涂擦治疗，观察两组患者的临床治疗效果及复发率。结果：随访半年后，研究组治疗总有效率为96.67%，复发率为3.33%，对照组治疗总有效率为76.67%，复发率为16.67%，研究组治疗总有效率显著高于对照组，复发率显著低于对照组，两组比较差异有统计学意义（P＜0.05）。结论：采用二氧化碳激光联合5-氟尿嘧啶治疗扁平疣，能有效的提高临床治疗效果，降低复发率，具有一定的临床应用价值。