无锡地区新型H7N9禽流感病毒基因变异分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sheng45724575
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目的

了解无锡地区第一次和第二次疫情新型H7N9禽流感HA和NA的基因位点变化情况。

方法

对各医疗机构送检的新型H7N9禽流感病毒,进行血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)核苷酸序列测定,用Bioedit和MEGA version 4.0分析软件进行基因种系进化特性分析。

结果

无锡市第一次和第二次疫情H7N9禽流感HA同源性为99.09%~99.55%,第二次疫情H7N9禽流感病毒在E116G、Q154R、L213S、C421Y、M475I位与第一次及其他域毒株不同;NA同源性为99.09%~99.77%,第二次进化树形成两簇,且每一簇都有环境株出现。

结论

通过对HA和NA基因序列的比对分析,新型H7N9禽流感从第一次到第二次疫情,氨基酸位点有一些改变,但第二次疫情毒株相对成簇。这表明,H7N9禽流感病毒在无锡地区人群中尚未出现流行,仍属于偶发和散发现象。

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