COL1A1在胃癌中的表达及临床意义

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目的利用生物信息学手段探讨胃癌中的差异表达基因及其临床意义。方法收集四个GEO胃癌数据集及TCGA胃癌数据集。分析各数据集中癌周组织和癌组织间存在显著表达差异的基因。对整合后的差异表达基因进行GO基因富集分析及KEGG信号通路富集分析。同时对差异表达基因编码的蛋白质进行蛋白互作网络分析。最后利用TCGA数据集分析了COL1A1基因的表达水平及其与患者TNM分期和生存的关系。结果整合四个GEO数据集的结果发现在癌周组织和癌组织间存在105个具有显著表达差异的基因,其中34个基因上调,71个基因下调。其中CO
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