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文章总结了山东种业科技发展的现状,分析了商业化育种过渡期内实行科企合作的必然性,剖析了深化科企合作面临的困境,如政策支持不配套、商业化育种机制不完善、缺乏完善的种业科研成果评估体系和交易平台、现有科企合作模式不能满足现代种业发展需要等,针对问题从完善法律法规、完善商业化育种机制、加大支持力度、创新合作模式等角度提出了深化科企合作的发展对策,以期为促进山东种业快速发展提供参考。