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随着DNA聚合酶X家族成员数量的增加,家族内部的系统发育需要重新检查.来自病毒和细胞的DNA聚合酶X家族成员序列第一次被汇编在一起,进行系统发育分析.分析显示:真核生物DNA聚合酶beta(polβ)是这个家族的祖先基因,可能与昆虫痘病毒(EPV)之间发生过基因的水平转移;DNA聚合酶mu(polμ)基因仅存在于哺乳动物基因组中,是脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)的重复基因;这个家族在低等真核生物的种系进化过程中发生了基因丢失.