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选用13个随机引物对葡萄孢菌14个种的全基因组DNA进行随机多态性扩增.共扩增出152条分子量在200~2 000 bp的DNA片段,多态检测率为98.8%.利用UPGMA方法对扩增的DNA片段聚类分析,结果表明:受试菌种相似率为种内(90%)大于种间(80%),具有丰富的遗传多样性,一些形态学上难以区分的相似种利用DNA分子指纹可被区别,此方法可供分类鉴定疑难种提供依据.