农村饮水安全工程实施以来，旬阳县抢抓机遇，共建成水厂413处，其中千吨万人工程4处，供水人口大于5000人的工程10处，由村镇供水公司负责供水人口共8.3万人，实际供水规模达5900立方米每天。“十一五”以前所建成的工程183处，大部分水厂设施配套不齐全，管护责任不明确、重建轻管，设施老化严重、运行困难。为有效解决农村饮水安全工程“有人用无人管”问题，确保每处工程都能“建得成、用得起、管得好、长收益”，真正惠及于民，近年来，旬阳县结合实际，大胆探索，创新管护机制促进农村安全饮水工程良好运行，让农村居民吃上干净水、安全水、放心水。
　　牢固树立“建管并重，以管为主”的运行管理理念，狠抓建后管理不放松。严格管理，建立责权明确的饮水安全管理体制，健全工程建设、运行、管理、养护、水源保护等各项规章制度，确保饮水安全工程有章可循，规范运行。县政府批准组建了县农村饮水安全管理站，负责全县22个乡镇农村饮水安全工程建设和管理。创新管理，建立适应市场经济机制的农村饮水安全工程运行管理机制，对竣工验收的项目明晰工程产权后及时办理交接手续，按工程规模实行分类管理。2013年底组建了旬阳县村镇供水公司，负责全县17个集镇供水的运行管理。县政府为村镇供水公司批设公益岗位55个，每年给予30万元补贴，公司业务由县水利局指导，实行企业化管理，独立核算，自负盈亏，各供水工程都实行有偿供水、计量收费。公司下设办公室、财务室、检测中心、安装队、供水应急抢救室、水费稽查室等业务科室，并按东、南、北三个自然区域，分社蜀河、吕河、甘溪三个中心站，下辖17个集镇供水站，统一按照“标准化建设，市场化运作，企业化管理，规模化发展”的理念经营运行，让供水运管单位在市场经济大潮中接受洗礼、磨练和成熟，增强经营管理能力，使其在发展中得以壮大，充分保障旬阳县农村供水正常运行。公司供水人口达到9.3万人，年供水量141万立方米。2014年，村镇供水公司总收入约320万元，基本达到收支平衡，有效提高了供水保证率和水质合格率。灵活管理，对村组供水工程由村镇供水公司进行指导管理，以经營权租赁形式为主，让有能力的人承包经营，实行企业化管理，对无人租赁的，动员用水户组建供水协会并推荐选举产生供水管理员，落实管护责任，确保饮水工程正常运行，日供水规模1.8万立方米，共解决不安全人口29.7万人。同时县政府出台了《旬阳县农村供水工程运行管理暂行办法》，安全饮水工程建成后的产权归属、运行管理、水费构成及计价机制、水源地保护及划分等遗留问题均得到了妥善解决。
　　旬阳县积极倡导以人为本的服务理念，始终要求农村饮水安全管理单位坚持服务于民、便利于民的服务宗旨，保持“急用户之所急、解用户之所难”的工作态度，不断规范供水服务，设立了供水服务热线和投诉电话，畅通与用户的沟通渠道，组建了供水安装服务队，及时为用户提供优质高效的维修安装服务，并对服务情况进行回访，有效提高了供水服务质量，得到了社会广泛的好评和支持。建立农村饮水安全水质检测中心，检测中心拥有办公用房、化验室120平方米，共有各项设备38种，可以按照《生活饮用水卫生标准》（GB5749-2006）对供水水质63项指标进行检测。对集镇供水做到每月检测一次，对大型村级供水一年检测一次。县水利局筹措了15万元资金，为各集镇供水站配备了自检设备，确保了水源污染应急和水源保护工作落实到位。同时县水利局积极争取民生工程税收优惠政策的落实，减小工程运行成本。该县农村饮水安全工程抽水用电全部按农业排灌电价标准执行，减小企业成本，减少农村负担。目前每户农民每月水费为5元左右，低廉的农村安全饮水工程水价和高质量的供水服务受到了农民群众的好评和肯定。