2008年5月,我国财政部会同中国证券监督管理委员会、中华人民共和国审计署、中国银行业监督管理委员会和中国保险监督管理委员会联合制定并发布了《企业内部控制基本规范》。2010年4月,国务院五部委又联合制定了《企业内部控制应用指引》,《企业内部控制评价指引》,《企业内部控制审计指引》。要求执行内部控制规范和内部控制评价的企业聘请会计师事务所对公司财务报告相关内部控制有效程度发表意见,而且对重大的非财务报告的内部控制缺陷进行有效披露。在此背景下,本文以内部控制审计规范性文件及相关研究文献为理论基础,以A公司为例,通过对其内部控制缺陷审计案例的实务分析,对内部控制审计方法进行了研究。本文一共分为五章,第一章对本文的研究背景、研究意义、研究方法进行了阐述,文章认为现代内部控制审计制度的产生,一是源于为了修复委托代理机制的失衡,二是源于内部控制经济学上的"外部性",三是制度本身产生和存在的合理性。文章认为本文的研究是非常重要的,可以完善公司内部控制和会计师事务所内部控制审计实务的执行,相关政策建议也适用于监管部门参考。本文采用了规范研究法和案例研究法。第二章首先介绍了内部控制的定义,对内部控制审计的概念进行了分析,对内部控制缺陷的概念进行了界定,而且与其他国家比较了上述关键词的定义。其次,对我国内部控制审计现行的法规进行了研究,结果发现法规存在滞后性。再次,对研究内部控制审计相关的文献进行了总结。最后,通过对我国当前企业管理中常见的内部控制缺陷、当前内部控制缺陷的认定和披露存在的问题的相关文献进行分析,对我国内部控制审计的现状进行了描述。.第三章是理论部分,内部控制缺陷审计相关的理论。从内部控制审计的方法,即全面审计法和风险导向审计法,内部控制审计中内部控制缺陷的识别方法,内部控制审计中内部控制缺陷的分类方法,到内部控制审计中内部控制缺陷的认定方法,内部控制审计后审计报告结论的形成方法,按照内部控制审计流程,对上述内部控制审计过程中的重点及相关应用方法进行了探索和研究。第四章将上述理论应用于A公司的内部控制审计案例,揭示了通过内部控制审计,A公司应出具何种类型的内部控制审计报告。鉴于我国内部控制审计的现状和内部控制审计当今存在的问题,结合A公司内部控制审计案例分析,笔者在第五章提出了改善并提高我国内部控制审计质量的相关建议。一是我国企业自身,要正确认识并理解内部控制缺陷,用发展和动态的眼光看待内部控制缺陷,从内部控制的不足之中寻找企业自身全面健康高效高速发展的可能性。二是我国会计师事务所,需要努力提升内部控制审计质量。三是监管部门要继续推进内部控制审计制度,并在立法层面和操作层面上予以细化的指导,建立长期的、联动的工作机制,在沟通反馈中提升内部控制审计的监管质量。