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微生物组学是新兴学科，与肠道、代谢、生殖、神经等大量慢性疾病相关。通过测序分析微生物组，主要包括16S rRNA和宏基因组两大技术。16S rRNA数据分析主要包括序列处理、样品多样性分析及统计分析3个步骤。宏基因组数据分析主要包括序列处理、分类、注释及统计分析4个环节。随着测序技术的升级，测序成本将逐步降低，而大数据分析将成为核心内容。数据的标准化和可积累性、通过数据建模和预测疾病的发生发展是未来应用的基础，数据知识产权保护以及数据本身价值的开发与保护价值将日益显现，培养和基于培养的功能验证将是未来的重