【摘 要】
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目的 筛选甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)显著差异表达的microRNA(miRNA),分析其与PTC 发病机制的相关性.方法 选取确诊的PTC 癌组织及癌旁正常组织样本各
【机 构】
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宝鸡市中医医院急诊科,陕西宝鸡721000;甘肃中医药大学,甘肃兰州730000;甘肃省人民医院普外科,甘肃兰州730000
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目的 筛选甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)显著差异表达的microRNA(miRNA),分析其与PTC 发病机制的相关性.方法 选取确诊的PTC 癌组织及癌旁正常组织样本各6 份,提取总RNA,采用转录组测序技术,筛选显著差异表达的miRNA,预测其靶基因并进行基因功能(Gene Ontology,GO)注释及信号通路数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;qRT-PCR法验证显著差异的miRNA在正常人甲状腺细胞(Nthy-ori3-1)及人甲状腺乳头状癌细胞(TPC-1 及kl)中的表达水平.结果 共测得2 036个miRNA,已知1 591 个,新发现445 个;共发现1 166 个miRNA 差异表达,表达上调446个,表达下调720 个,其中miR-124、miR-7 显著下调,miR-494、miR-106a-3p及novel-miR-26显著上调.经GO及KEGG分析,这5 个显著差异miRNA 的靶基因参与细胞周期、迁移及凋亡,与AMPK、Axon guidance、氨基酸代谢等信号通路的激活关系密切.novel-miR-26 在TPC-1 及kl 细胞中表达量较在Nthy-ori3-1 细胞中相对高表达(P均＜0.01);miR-124 在TPC-1 及K1 细胞中的表达量较在Nthy-ori3-1 中相对低表达(P均＜0.01).结论 显著差异表达的 miR-124、miR-494、miR-106a-3p、miR-7及 novel-miR-26 可作为PTC潜在的分子标志物;Axon guidance、AMPK及蛋白代谢等信号通路在PTC 的调控机制中起重要作用.
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