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农业生态学近年的发展一方面受到生态学发展的带动，另一方面受至改善农业生态环境的需求的推动。近年研究活跃的方向有：农业可持续发展与农业生态系统模式方面，作物与土壤系统的养分、水分及有机质关系方面，群体生产中的作物冗余问题方面，农业的化学生态学方面，农业分子生态学方面，农业生产的生态环境管理与品质管理方面，农业生态信息综合分析与评价方面。