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区属公立医院在我国医疗卫生体系中具有重要的地位，肩负着疾病诊疗、医学研究、科研创新、人才培养等重大职能，对社会的稳定发展有着重要的促进作用。专项资金是公立医院完成各项工作任务、促进医院发展的重要资金来源，因此，提高专项资金的使用效益对区属公立医院来说具有非常重要的意义，必须加大内部审计检查力度，保证专项资金的效用能充分发挥出来。文章简述了区属公立医院专项资金内部审计检查的内容，并对审计中发展的问题进行了具体分析，最后提出加强区属公立医院专项资金内部审计检查的措施。