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麋鹿苑种子植物246种（含栽培植物），隶属182属，69科．其中裸子植物3科6属11种，双子叶植物56科132属182种，单子叶植物10科44属53种．麋鹿苑种子植物区系包含15个分布区类型及10个变型，麋鹿苑种子植物属的分布类型中，温带性质的属有46属，占主导地位；除世界分布属及热带分布属，所占比例达57．3％，反映出该苑的种子植物的分布与本地所处的气候带相适应；该苑种子植物世界分布属有33属，占总属数28．1％，也是湿地植被的主要组成或关键属．该苑特有属匮乏（均为栽培种）．