拟南芥ago1-27突变体的RNA-seq分析

来源 :深圳大学学报(理工版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：war3mx1017

【摘要】

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miRNA在植物生长发育和环境适应等方面起着极为重要的作用.本研究对拟南芥ago1-27突变体进行了RNA-seq,鉴定到几千个差异表达基因,并且miRNA靶基因倾向于在ago1-27中表达上调

【作者】

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马轩李盛本莫蓓莘曹晓风陈雪梅

【机构】

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深圳大学生命与海洋科学学院,中国科学院遗传与发育生物学研究所,中国农业科学院深圳农业基因组研究所,美国加利福尼亚大学河滨分校植物科学系

【出处】

：

深圳大学学报(理工版)

【发表日期】

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2017年1期

【关键词】

：

植物生物化学 miRNA ago1-27基因 RNA-seq 降解组靶基因拟南芥

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(31571332,31210103901,91440105)~~

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miRNA在植物生长发育和环境适应等方面起着极为重要的作用.本研究对拟南芥ago1-27突变体进行了RNA-seq,鉴定到几千个差异表达基因,并且miRNA靶基因倾向于在ago1-27中表达上调.ago1-27 RNA-seq结合降解组分析鉴定到新的miRNA靶基因,如miR396靶向半胱氨酸蛋白酶基因和miR167靶向编码AT-hook DNA结合蛋白的基因等.

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