芥菜型油菜A9染色体BAC物理图谱构建及比较基因组分析

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为获得高精确度的芥菜型油菜A 9染色体物理图,本研究利用定位在A 9染色体上的标记对芥菜型油菜BAC文库进行三维混合PCR筛选,共得到阳性BAC 3200个;构建了由1 6 个重叠群、5 个单拷贝组成的芥菜型油菜A 9染色体物理图谱.根据最小路径原则挑选代表整个物理图的种子BAC 4 3 5 个,并进行双末端测序,得到质量良好的序列862条;按照BAC平均插人片段为126 k b ,可知所有重叠群累积达52. 08 M,覆盖A 9染色体的1. 37倍.利用BLAST软件( 按参数值E 〈 1e - 10)
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