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兽医微生物学主要研究病原微生物的特征及其与动物疾病之间的关系，并应用微生物学、分子生物学和免疫学知识与技术来诊断和防治动物疫病以及人兽共患病，在保障畜牧生产发展、动物源性食品安全和人类健康方面起着重要作用。近20年来，伴随着分子和细胞生物学理论和技术的飞速发展，兽医微生物学在基础研究、技术创新和应用方面均取得了重要进展。特别是在病原微生物研究、微生物功能基因及蛋白组学研究、病原微生物致病机制研究、微生物检测技术研究、有益微生物的研究与利用等方面取得了长足进展。