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目的：分析阿米替林联合多潘立酮治疗功能性消化不良的临床疗效。方法：将2015年1月到2016年1月本院收治的103例功能性消化不良患者作为研究对象，将患者随机分为观察组52例和对照组51例。对照组采用多潘立酮治疗，观察组采用阿米替林联合多潘立酮治疗，对比两组患者的临床治疗效果及不良反应发生情况。结果：观察组患者的临床治疗总有效率为96.15%（50/52），对照组患者的临床治疗总有效率为86.27%（44/51），两组患者治疗效果对比具有明显差异（P＜0.05）；观察组患者的不良反应发生率为3.85%（2/52），对照组患者的不良反应发生率为5.88%（3/51），两组患者不良反应发生率对比不存在显著差异（P＞0.05）。结论：阿米替林联合多潘立酮治疗功能性消化不良的效果较为显著，患者的康复情况比较理想，不良反应发生几率较低，有助于患者生活质量的快速提升。