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多数家畜的经济性状是数量性状,如羊毛品质、肉质、生长速度、抗病力等。每个性状都是由多个基因调控的,而且这些基因对性状的影响大小是不均衡的,有的是主效基因,有的是辅助基因。微卫星DNA在染色体上是高度随机分布的,如果证实微卫位点专一性地与某主效基因之间是连锁的,那么微卫星标记的位置就可以辅助定位该主效基因。