2017年安庆市急性胃肠炎暴发疫情病原体诺如病毒的鉴定及基因特征分析

来源 :中国病原生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:simonhill
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目的对安徽省安庆市2017年2-3月间发生的10起急性胃肠炎暴发疫情病原诺和病毒进行鉴定及基因分型。方法采集聚集性和暴发疫情中有胃肠炎症状者的肛拭子标本,采用实时荧光定量RT-PCR检测诺如病毒(NoV)核酸,使用RT-PCR对核酸阳性标本扩增NoV衣壳区-聚合酶区,选取27份琼脂糖电泳条带清晰的阳性标本进行基因测序及型别鉴定,并与国内外参考株序列构建进化树,进行遗传进化分析。结果 10起胃肠炎暴发疫情中共采集103份肛拭子标本,实时荧光定量RT-PCR检测诺如病毒核酸阳性41份,且均为GII型,阳性率为39.81%。选取27份阳性标本测序,其中20份测序成功,进化分析显示19条序列为NoV GII.P16/GII.2,1条序列为NoV GII.P17/GII.17。结论诺如病毒GII.P16/GII.2是安庆市2017年2-3月份急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体。
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