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高校科研经费管理模式亟待改革,“负面清单”是一种值得借鉴的思路。基于“负面清单”管理理念,科研经费管理改革可以结合高等院校综合改革开展,简化科研经费管理办法,推广科研项目资金建卡制度,优化科研成果评价与激励机制。改革可取得规避“事前审批”模式的负面效应、激发科研项目的创新驱动力、推进现代大学制度的构建等预期效益。