基于网络药理学-分子对接探讨维生素C和甘草酸联合防治新型冠状病毒肺炎的作用机制

来源 :云南民族大学学报(自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:googto0726
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基于网络药理学技术探索维生素C(Vitamin C,VC)和甘草酸(glycyrrhizic acid,GA)联合防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SuperPred、SEA Search Server(SEA)、DrugBank、Comparative Toxicogenomics Database(CTD)和SwissTargetPrediction数据库综合相关文献获得VC和GA功能靶标,在Genecards、OMIM、DisGeNET和TTD数据库中获取COVID-19的治疗靶点;利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-疾病-靶点”可视化调控网络图;在DAVID数据库找寻GO、KEGG通路相关数据,进一步对VC和GA联合对抗COVID-19的作用机制进行GO富集分析、KEGG通路分析以及蛋白互作网络分析(PPI);最后,运用Autodock vina软件对VC和GA与核心靶点进行分子对接.筛选获得VC功能靶标667个、GA功能靶标154个以及新冠病毒致病靶点1586个,其中VC及GA共有45个功能靶标与病毒致病靶点相对应.综合PPI结果,总结Degree值与BetweennessCentrality值前五位的靶点,得出主要关键靶点为ALB、MAPK3、EGFR、IL2、MAPK1、CTLA4等.GO富集分析在生物过程方面为肽基丝氨酸磷酸化等较集中,分子功能方面主要涉及蛋白磷酸酶结合、蛋白质结合等,细胞组成方面涉及细胞表面、胞外外泌体等;KEGG通路共计104条,取前10条分析得出靶点作用信号通路集中在5-羟色胺能突触.分子对接结果显示,VC和GA与SARS-CoV-2 3CL水解酶、血管紧张素转化酶II(ACE2)和核心靶点具有较强的结合能力.VC和GA联合可能通过调节和增强免疫系统的激活,在COVID-19的预防和治疗中发挥重要作用.
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