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目的：考察同源二聚体转录因子的2个识别螺旋在自由状态下和结合状态下相对运动的特征。方法：从蛋白质结构数据库（PDB）得到1R4I、3JXB、1KB2、1LE8等4个复合物结构文件,分别在自由状态和结合状态下用NAMD进行16 ns分子动力学模拟,将2个识别螺旋所成角分解为垂直偏移角和水平偏移角,并做散点图。结果：2个中心对称结合的同源二聚体转录因子在2种状态下,2个偏移角都相等;串联结合的同源二聚体在结合状态下2个偏移角相等。结论：同源二聚体转录因子识别螺旋相对运动存在平面摆动现象。