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因子分析法是主成份分析方法的推广和深化，是把原来多个变量化为少数几个综合指标的一种统计方法，使用因子分析方法可以损失较少信息，减少评价指标，针对主因子进行分析，使水质评价结果更为合理和有效。本文采用因子分析方法对博斯腾湖水质数据进行分析，识别出影响博斯腾湖水质的3个主因子。因子1以高锰酸钾指数（CODMN）、总硬度、总氮（TN）、pH值、硝酸盐（NO3^-）为主，揭示了无机物的污染指标；因子2以总磷（TP）和生化需氧量（BOD）为主。揭示了有机污染指标；因子3以溶解氧（DO）为主，反映了生活类污染状况。