受民政部委托，中民慈善捐助信息中心在本届慈展会上发布《2013年度中国慈善透明报告》。《报告》显示，2013年度我国慈善透明指数为43.11（总分为ICE）），与去年相比，透明度提高了33.1%。
　　1000家监测样本透明指数分析结果显示，2013年度，我国慈善透明指数达到60以上的公益慈善组织比例从20.4%上升至29.6%，进步明显。而透明指数达到90以上的公益慈善组织，从去年仅2家增长为今年的70家，涨幅较大。其中，有46家是基金会，包括28家公募基金会和18家非公募基金会。此外，2013年度，有18家慈善会的透明情况步入卓越行列。
　　从不同类型的组织之间的比较来看，2013年度，基金会整体透明度最高，与上一年度相比，其透明指数的增长幅度也是最大的，尤其是非公募基金会，增幅达到45.2%。此外，慈善会的透明指数较之上一年，也增长了26.1%。
　　基金会中心网《中国基金会透明度发展研究报告》蓝皮书发布会上，清华大学公共管理学院教授、廉政与治理研究中心主任程文浩介绍了我国基金会的透明度情况，表示全行业透明度总体偏低。程文浩指出，净资产最多的基金会，未必就是透明度最高的基金会，在净资产最大的100家基金会中，有25家透明度排在1000之外；在捐赠收入最大的100家基金会中，有23家透明度排在1000之外。同时，而不少基金会收入支出比例严重失衡，却依然能够每年通过年检。
　　程文浩在报告中指出，中国基金会透明度存在四个问题，一是全行业透明度总体偏低，行业整体透明度得分不及格。六成基金会合规性信息披露不合格，未按条例要求公开信息但依然通过年检；全国有20多家基金会除了能找到名称之外，几乎无其它任何信息；有40余家基金会没有联系信息，即公众无法与之联系。第二是地区差异明显，比如贵州省和内蒙古自治区就相差悬殊；第三是个体差异显著：37家基金会满分，但最低的基金会仅0.8分；第四个问题是：各系统基金会透明度差异显著，青少年系统的基金会得分最高，人民教育基金会得分最低。
　　程文浩还特别指出，基金会年报对外披露情况并不能让人满意，各基金会的信息发布显得无序和随意。截至2013年3月，仅有9家登记机关管理下的基金会在中国社会组织网上披露2011年报全文，而有18家民政部门没有在指定渠道披露任何基金会2011年的年报信息。