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合作创新的多主体性特征使得伙伴选择成为合作创新项目实施需要考虑的关键要素。基于项目视角,企业合作创新风险可以划分为前期风险、中期风险和后期风险,通过建立企业合作伙伴选择与合作创新风险的作用机理模型,分析了企业合作创新风险的类型,验证了伙伴选择因素对合作创新风险形成的作用路径及影响程度,明确了合作创新各阶段需要重点关注的合作伙伴行为可能产生的风险:合作创新项目在前期应重点关注合作个体因素和后效应因素;合作创新项目在中期应关注个体因素和关系因素的影响;合作创新项目在后期应重点关注合作关系因素的影响。