日本百脉根γ-生育酚甲基转移酶基因的电子克隆及进化分析

来源 :安徽农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wxpsth

【摘要】

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根据物种间同源基因相对保守的特点，利用生物信息学方法，以拟南芥γ-生育酚甲基转移酶cDNA序列为信息撂针，在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的日本百脉根基因组DNA序列

【作者】

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孟宪萍李晓晓李雅轩蔡民华胡英考

【机构】

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首都师范大学生命科学学院

【出处】

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安徽农业科学

【发表日期】

：

2006年24期

【关键词】

：

日本百脉根 Γ-生育酚甲基转移酶电子克隆 EST Lotus corniculatus var.japonicus γ-TMT in silico clo

【基金项目】

：

北京市教委科技发展计划项目基金资助（200310028112）.

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根据物种间同源基因相对保守的特点，利用生物信息学方法，以拟南芥γ-生育酚甲基转移酶cDNA序列为信息撂针，在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的日本百脉根基因组DNA序列——LjT44D21克隆。通过GENSCAN分析厦序列拼接得到日本百脉根γ-TMT基因的cDNA序列，GenBank的登陆号为DQ013360。用该序列对GenBank中的eat-others进行相似性搜索，获得了44条日本百脉根的EST序列，经拼接后发现与基因组预测的基因序列一致，表明该基因是真实存在和表达的。该cDNA序

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