基于表示学习和深度森林的长链非编码RNA编码短肽预测模型

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长链非编码RNA(lncRNA)中的小开放阅读框(sORFs)能够编码长度不超过100个氨基酸的短肽。针对短肽预测研究中lncRNA中s ORFs特征不鲜明且高可信度数据尚不充分的问题,提出一种基于表示学习的深度森林模型。首先,使用常规lncRNA特征提取方法对s ORFs进行编码;其次,通过自动编码器进行表示学习获得更加有效的特征表示;最后,训练深度森林模型实现对lncRNA编码短肽的预测。实验结果表明,该方法在拟南芥数据集上能够达到92.08%的准确率,高于传统机器学习模型、深度学习模型以及组合
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