【摘 要】
:
目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨“土茯苓-茵陈”药对治疗银屑病的功效物质基础和作用机制.方法 使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索“土茯苓-茵陈”药对的活性化合物和作用靶点,通过人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因名片数据库(Genecards)、遗传药理学与药物基因组学数据库(PharmGkb)以及药物靶标数据库(TTD)查找银屑病的相关靶点,构建“药物-共同靶点-疾病”网络图,针对核心组分和银屑病的共同靶点,构建蛋白互作网络(PPI),进而完成基因功能注释(GO)、京都基因与基因组百科
【机 构】
:
天津中医药大学,天津301617;天津医科大学研究生院,天津300070;天津市中医药研究院附属医院,天津300120
论文部分内容阅读
目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨“土茯苓-茵陈”药对治疗银屑病的功效物质基础和作用机制.方法 使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索“土茯苓-茵陈”药对的活性化合物和作用靶点,通过人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因名片数据库(Genecards)、遗传药理学与药物基因组学数据库(PharmGkb)以及药物靶标数据库(TTD)查找银屑病的相关靶点,构建“药物-共同靶点-疾病”网络图,针对核心组分和银屑病的共同靶点,构建蛋白互作网络(PPI),进而完成基因功能注释(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.利用DockThor软件对主要化合物和主要靶点进行分子对接.结果 以口服生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18为标准,筛选出“土茯苓-茵陈”药对的活性化合物共有26种,作用靶点有103个;以高相关性为标准,筛选出银屑病的高关联度靶点一共有1475个,药物与疾病的共同靶点一共有44个.构建PPI,分析共同靶点之间的相互关系最多的靶点为白细胞介素(IL)-6、血管内皮生长因子(VEGF)-A、表皮生长因子受体(EGFR).GO富集分析共包含697条结果,显示共同靶点的功能主要表现在氧感知相关通路,KEGG信号通路富集显示,共同靶点表达在122条信号通路中.分子对接进一步验证了“土茯苓-茵陈”药对治疗银屑病的机制.结论 “土茯苓-茵陈”药对通过多成分、多靶点,主要调节氧感知相关通路发挥治疗银屑病的作用.
其他文献
目的:评价活化自体淋巴细胞过继性免疫治疗(adoptive immunotherapy,AIT)是否有助于改善原发性肝细胞癌的临床疗效.方法:选取2016年8月至2018年12月在中国人民解放军总医院第五医学中心确诊的64例原发性肝细胞癌患者,通过分层随机法分为免疫治疗组(n=29)和对照组(n=35).免疫治疗组患者取60 ml外周血分离制备单个核细胞并在含OKT-3和IL-2的培养基中活化培养,回输前进行质控检测.免疫治疗组中的Ⅰ~Ⅲ期患者(n=14)于一线治疗后接受自体淋巴细胞输注(3个月内输注6次
低氧微环境是大多数恶性肿瘤的重要特征.在低氧环境下,低氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIF)高度表达,通过诱导VEGF表达促进恶性肿瘤血管生成并增加血管通透性、通过调控免疫细胞作用促进免疫抑制和肿瘤细胞的免疫逃逸,进而促进肿瘤的恶性进展.目前,已研究多种HIF的靶向抑制剂,其作用机制包括降低HIF转录活性、抑制HIF表达和诱导HIF降解等,相关药物多处于临床前或临床研究阶段,走向临床应用的过程中仍有很多问题亟待解决,如HIF抑制剂单药治疗或与放疗、化疗联合应用,特别是不同
目的:探讨miR-183对脑胶质瘤细胞放射敏感性的影响.方法:2020年10月至2021年6月,收集秦皇岛市第一医院40例脑胶质瘤组织标本,对T98G细胞进行梯度剂量X射线(0、2、4、6 Gy)照射.采用qPCR检测miR-183、细胞质多腺苷酸化元件结合蛋白1 (cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1,CPEB1)在脑胶质瘤组织、T98G细胞和经X射线照射的T98G细胞中的表达量.将miR-183 inhibitor转染T98G细胞后
在基础研究方面,业已证实lncRNA主要以癌基因或抑癌基因两种形式参与白血病细胞的增殖、分化或凋亡过程,是白血病发生和发展的重要因素.临床研究表明,lncRNA与白血病的诊断、分型、风险分级和预后判断有关,具有成为临床病情监测的生物标志物潜力.以lncRNA siRNA为代表的白血病治疗性分子产品也表现出了良好的应用前景.但是,lncRNA在AML领域的研究依然面临着许多问题和挑战,需要进一步筛选特异性较高的关键标志性和功能性lncRNA,通过大型队列非干预性临床试验验证其作为生物标志物或治疗靶点的可行性
目的:探讨PD-1抑制剂治疗晚期肺癌患者的疗效及其对患者外周血T淋巴细胞亚群及细胞因子水平的影响.方法:选择2018年8月至2020年12月于海口医院就诊的肺癌患者50例,选取同期体检健康者50例作为对照,免疫组化法检测肺癌组织中PD-1的表达.肺癌患者均接受纳武利尤单抗(nivolumab)或帕博利珠单抗(pembrolizumab)治疗,于治疗前1天、治疗1周期结束、治疗4周期结束时进行静脉血采集,治疗4周期后进行CT或MRI检查评价肿瘤大小,将评价为完全缓解(complete response,CR
PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂(ICI)在单药或联合治疗肝细胞癌(HCC)的临床试验显示出较好的疗效和安全性,为其临床应用提供有利的科学依据.单药治疗HCC的PD-1/PD-L1 ICI包括纳武利尤单抗(nivolumab)、帕博利珠单抗(pembrolizumab)和卡瑞利珠单抗(camrelizumab),主要用于肝癌的二线治疗.虽部分HCC患者可以对PD-1/PD-L1 ICI单药治疗产生持久的反应,但总体受益的患者仍然较少.PD-1/D-L1 ICI联合治疗显示出更好的免疫应答和控制.目前,
神经母细胞瘤是儿童最常见的实性颅外恶性肿瘤,常常发生转移性扩散,晚期预后差.靶向免疫治疗(如靶向GD2和B7-H3)在神经母细胞瘤治疗中的效果已在临床对照试验中得到证实,美国FDA已批准靶向GD2的dinutuximab和naxitamab用于治疗儿童神经母细胞瘤.最近一些研究表明,P物质(SP)通过神经激肽1受体(NK-1R)激活一系列信号通路,介导多种肿瘤的发生发展.SP通过NK-1R在神经母细胞瘤细胞中发挥以下作用:促进细胞有丝分裂、促进细胞迁移(侵袭和转移)、抗凋亡和增加糖酵解效率(肿瘤细胞因此增
目的:寻找多发性骨髓瘤(MM)基因芯片数据集中的潜在致病基因、疾病诊断和预后相关因子并阐明其作用机制.方法:获取基因芯片数据集GSE13591和Zhan Myeloma,使用R语言进行基因差异表达分析.对共同高表达基因进行Meta分析,得到P值中位秩次TOP10基因.CCLE数据库分析TOP10基因在各肿瘤细胞系中的mRNA表达情况,筛选出蛋白酶体通路相关基因8(DCAF8).cBioPortal数据库中分析DCAF8基因在各肿瘤细胞系的突变率.WB检测DCAF8蛋白在骨髓瘤细胞系中的表达情况.SPSS和
结直肠癌(CRC)分子分型的方法与研究进展主要从基因组学、转录组学和蛋白质组学3个方面展开.依据基因突变和基因组的细胞遗传学改变进行分型,可以将CRC分为错配修复缺陷导致微卫星不稳定的超突变肿瘤、具有DNA聚合酶epsilon或Delta 1核酸外切酶结构域突变的超突变肿瘤、具有高频率DNA体细胞拷贝数改变的染色体不稳定性肿瘤等.基于肿瘤的上皮间质转化、错配修复基因缺陷导致的微卫星不稳定性和细胞增殖相关的高突变频率,可分为MMR缺陷型上皮亚型(A型)、增殖性上皮亚型(B型)和间充质亚型(C型).根据基因表
PD-1/PD-L1抑制剂在晚期胃癌(GC)及胃食管交界癌(GEJC)的临床试验中显示出较好的疗效及安全性,为其临床应用提供了有力的科学依据.单药PD-1/PD-L1抑制剂治疗的疗效欠佳,仅作为后线治疗选择.PD-1/PD-L1抑制剂联合多种治疗模式能够提高患者的疾病应答率和延长患者生存时间,成为目前GC及GEJC治疗的热点.本文基于最新临床试验结果,对晚期GC及GEJC的免疫治疗疗效及预测分子进行综述.