【摘 要】
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采用IlluminaHi-seq2500转录组高通量测序,构建黄秋葵花和果荚转录组文库,并利用测序评估、差异基因功能注释等生物信息学方法进行分析。研究结果表明:(1)分别获得黄秋葵花和
【基金项目】
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福建省公益类项目(2016R1012-1);福建省农业科学院芳香植物创新科技团队(STIT2017-2-11)
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采用IlluminaHi-seq2500转录组高通量测序,构建黄秋葵花和果荚转录组文库,并利用测序评估、差异基因功能注释等生物信息学方法进行分析。研究结果表明:(1)分别获得黄秋葵花和果荚有效数据7.12Gb和8.14Gb,碱基百分比(Q30)均达到91.0%以上。(2)获得差异表达基因(DEGs)1336个,其中上调基因319个,下调基因1017个。(3)获得功能注释的基因有1131个,GO将455注释基因归成41个功能小类,主要涉及代谢过程、催化活性、单一生物过程和细胞过程等过程;KOG注释了472个
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