【摘 要】
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DNA甲基化是表观遗传修饰的途径之一,在维持生物基因组稳定性与调控基因转录和表达中起着重要作用.为明确棉花愈伤组织分化过程中基因组DNA的甲基化变异模式以及甲基化图谱,
【机 构】
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河南科技大学农学院,洛阳,471023;河南科技大学食品与生物工程学院,洛阳,471023
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DNA甲基化是表观遗传修饰的途径之一,在维持生物基因组稳定性与调控基因转录和表达中起着重要作用.为明确棉花愈伤组织分化过程中基因组DNA的甲基化变异模式以及甲基化图谱,本研究利用全基因组亚硫酸盐测序(WGBS)技术对棉花愈伤组织分化(非胚性与胚性)过程中的DNA甲基化模式进行了全面比较.全基因组DNA甲基化分析表明,在棉花愈伤组织分化过程中非胚性愈伤组织的mCG与mCHG所占比率高于胚性愈伤组织,而不对称mCHH的比率则低于胚性愈伤组织;非胚性愈伤组织的mCG、mCHG、mCHH及mC的平均甲基化水平均低于胚性愈伤组织.基因组甲基化区域分析表明,棉花愈伤组织分化过程中基因间、启动子和基因下游(转录终止位点下游2 kb)的甲基化水平较高,同时胚性愈伤组织的基因间、启动子及基因下游的平均甲基化水平均高于非胚性愈伤组织.因此,本研究分析了棉花愈伤组织全基因组DNA甲基化水平,为进一步研究棉花体细胞胚胎发生的表观遗传机制提供了依据.
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