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以马铃薯生产淀粉产生废弃物为发酵培养基，选用酿酒酵母（Saccharomy cescerevisiae）与产朊假丝酵母（Candida utilis）为原始菌株，经紫外诱变后，筛选出两株蛋白产量显著提高并遗传稳定的突变株：S57和U112，蛋白产量均为8.43 g·L-1。将两种菌种混合比例设定为1??1，按照1%（V/V）进行接种，在葡萄糖浓度为35 g·L-1培养基中对两株菌种进行共培养，利用响应面分析法对其发酵产蛋白能力进行优化，研究pH、温度及转速。对结果进行分析，确定在培养基初始pH 7.7，培养温度为27.7℃且转速为187 r·min-1时，蛋白产量达到理论最大值，为9.02 g·L-1。验证试验显示，蛋白产量达到（9.19±0.05）g·L-1，证明模型可信，COD去除率达到80%。