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土壤源CH4氧化主要受土壤理化性状、温度、施肥种类和施肥量、作物品种及其生长状况、重金属离子种类与浓度等因子的影响。这些因子主要通过影响CH4氧化细菌群,种类数量、活性及其分布模式产生作用,合理施用有机肥、调节田间水分、配施矿质肥料以及培养根系活力较强的高产水稻品种是减少土壤源CH4排放量的主要措施 。