基于可变剪切事件探讨鳖甲煎丸抑制肝癌细胞的研究

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目的 探讨可变剪切事件在鳖甲煎丸抑制肝癌细胞过程中的变化和作用机制。方法 鳖甲煎丸血清(干预组)、空白血清(对照组)分别作用于人肝癌细胞株SMMC-7721,观察两组肝癌细胞株增殖活性后,应用全细胞转录组学检测和分析两组肝癌细胞株的可变剪切变化以及基因的差异表达。结果 (1)干预组的肝癌细胞株增殖活性较对照组受到显著抑制;(2)转录测序后,干预组鉴定出5736个基因对应20447个可变剪切事件,对照组中鉴定出 5533个基因的18955个可变剪切事件,且均以外显子跳跃剪切和第一个外显子可变剪切两种可变剪切类型为主;(3)对两组可变剪切事件的基因进行比对发现,干预组新增加了1061个可变剪切基因,差异表达分析鉴定出96个表达显著差异的可变剪切基因。其中有9个可变剪切基因与肿瘤发生、发展密切相关,它们分别是:ARHGAP8、ATP5L2、BIRC7、CASP9、HES5、INPP4B、SLC6A19、TNRC18、TPT1;(4)对上述9个基因进行生存分析发现,CASP9、HES5、INPP4B、SLC6A19的表达与肝细胞癌患者生存率显著相关(P<0.05)。进行风险因素分析发现,这些基因分别在不同肝炎病毒以及酒精摄入所致的肝癌中起到保护因素的作用。结论 可变剪切事件参与了鳖甲煎丸抑制肝癌的过程,可变剪切所致的差异表达基因对鳖甲煎丸抑癌调控相关研究奠定了基础。
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