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SARS和A／H1N1两起公共卫生事件先后挑战我国的应急管理，在带来巨大财产和人员损失时，也留下宝贵的经验教训，促成了我国政府管理理念的重大转变。本文对两次事件的管理模式进行比较研究后认为：突发公共卫生事件应急管理模式从“冲击-回应”型转向“预防-主动”型是一个长期的过程；需要从总体框架入手，建立与完善纵向三级CDC主导、横向五网协同的应急管理体制；集成体制和机制，实现预防先行与主动应急的整合、卫生系统与跨卫生系统的整合、政府主导与社会参与的整合。