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Ⅱ组内含子（group Ⅱ intron）存在于原生生物、真菌、藻类、植物细胞器以及细菌和古细菌基因组中，在体内，Ⅱ组内含子可通过两步连续的转酯反应从前体RNA中自剪接，并连接两侧外显子，许多Ⅱ组内含子的剪接反应是由蛋白质辅助完成的，这种蛋白质有的是由内含子编码，有的是由宿主基因编码．Ⅱ组内含子能够有效地归巢进入无内含子的等位基因，也能够以低频率逆转座进入非等位基因，转座过程依赖内含子RNA和内含子编码的蛋白质（内切核酸酶活性和逆转录酶活性），本论文在总结Ⅱ组内含子最新研究成果的基础上，分析Ⅱ组内舍子可能