【摘 要】
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目的 :研究银屑病患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)内转录因子AP1家族中Fos家族中Fra2的表达情况,通过生物信息学分析银屑病中Fra2可能参与调节
【机 构】
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上海交通大学医学院附属仁济医院风湿科;
【基金项目】
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国家自然科学基金(81273306;81771729);国家重点研发计划(2017YFC0909002)
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目的 :研究银屑病患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)内转录因子AP1家族中Fos家族中Fra2的表达情况,通过生物信息学分析银屑病中Fra2可能参与调节的下游基因,并通过双荧光素酶报告实验验证,初步探讨其在疾病中的发病机制。方法:采用实时定量PCR检测21例银屑病患者及30名健康者对照外周血中Fra2的表达水平;在基因转录调节数据库上预测Fra2的靶基因,并与Gene Cards上银屑病相关基因交集分析,采用DAVID(The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)数据库查找靶基因本体功能分类和KEGG富集分析;用实时定量PCR验证Fra2可能参与调控的基因;R语言调用JASPAR 2018软件包预测Fra2结合位点;双荧光素酶报告实验验证Fra2对白细胞介素23受体(interleukin 23receptor,IL-23R)的调控关系。结果:21例银屑病患者PBMC中Fra2的mRNA表达水平(0.711±0.072)显著低于健康人群(1.070±0.086)(P=0.004 2);生物信息学分析显示,炎症反应和细胞因子-细胞因子受体互作是富集程度最为显著的条目(P=5.2×10-71;P=7.0×10-45);实时定量PCR检测显示,IL-23R的mRNA表达水平显著高于健康人群(P=0.000 1),且与Fra2表达水平呈显著负相关(r=-0.509 5,P=0.018 3);用R语言调用JASPAR在启动子区域预测了Fra2的结合位点,双荧光素酶报告实验发现,Fra2调控了IL-23R的表达。结论:Fra2/AP1作为重要的转录因子,可能通过调节IL-23R的表达参与了银屑病的发生和发展。
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