目的：基于网络药理学比较酸枣仁与酸枣果肉抗失眠作用的物质基础及作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、BATMAN-TCM、中医百科全书（ETCM）数据库及文献等筛选酸枣仁与酸枣果肉的活性成分及靶点；通过GeneCards、NCBI数据库检索失眠疾病的靶点；将活性成分对应靶点与疾病靶点相互映射获取共同靶点，利用DAVID 6.8数据库对共同靶点进行基因本体（GO）功能过程和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，预测其作用机制；通过Cytoscape 3.8.0构建网络并对其进行拓扑分析，得到酸枣仁与酸枣果肉抗失眠的核心成分及核心靶点；比较酸枣仁与酸枣果肉抗失眠的异同点，最后通过分子对接方法进行间接验证。结果：通过数据库及文献筛选得到酸枣仁活性成分17个，靶点579个；酸枣果肉活性成分15个，靶点410个。筛选得到失眠疾病相关靶点2563个，映射得到酸枣仁与失眠疾病的共同靶点151个，酸枣果肉与失眠疾病的共同靶点116个。通过富集分析比较，酸枣仁与酸枣果肉均可通过槲皮素、棕榈酸等核心成分及磷酸肌醇-3-激酶（PIK3CG）、肿瘤坏死因子（TNF）、蛋白激酶B1（Akt1）等核心靶点作用于肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、多巴胺能突触、血清素能突触、γ-氨基丁酸（GABA）能突触、核转录因子-κB（NF-κB）等信号通路治疗失眠。分子对接发现筛选得到的活性成分与靶点结合能力较强。结论：对酸枣仁与酸枣果肉治疗失眠的作用机制进行初步预测与比较，发现二者存在7种共同活性成分及357个共同靶点，生物过程及信号通路有很大相似性，表明酸枣果肉及酸枣仁在治疗失眠的物质基础及作用机制存在一定共性，进一步为酸枣资源的综合利用提供了研究依据。