基于深度学习的蛋白质-ATP结合位点预测

来源 :吉林大学学报(工学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:sirius1394
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了提高识别蛋白质-ATP结合位点预测精度,提出了基于Inception架构的深度网络模型Inception_base,同时对网络模型和训练策略进行优化和改进,提出了新的网络模型Inception_ evolution.通过两组数据集在该模型上测试,获得AUC分别为0.885和0.918,均优于其他对比机器学习方法.实验结果表明,深度学习方法可以应用于蛋白质-ATP结合位点预测问题中,该模型能够更精确预测蛋白质-ATP结合位点.
其他文献
针对车身结构在涂装过程中温度变化对钢铝胶铆连接结构的影响,研究了影响结构热应力的主要因素.在钢、铝、粘接剂的单向拉伸试验和热膨胀试验基础上进行钢铝胶铆连接结构高温热膨胀试验,获得了钢板、铝板表面的应变值.建立了钢铝胶铆连接结构热膨胀有限元仿真模型,通过试验验证了仿真模型的有效性.分析胶铆结构在升温、保温、降温过程中的应力变化情况,获得了钢铝胶铆连接结构在厚度方向上尺寸随温度的变化规律.研究了粘接剂厚度、粘接宽度和金属铆接顺序对钢铝胶铆连接结构在高温作用下的影响.结果 表明,钢铝胶铆连接结构在经历高温作用后
车联网环境中,交通系统将长期呈现智能网联汽车和传统人工驾驶车辆混合共存的状况,聚焦智能网联交通环境下的新型混合车流,建立了车辆换道行为的决策模型.引入车辆换道过程中动态风险模型,建立网联混合交通流自主车辆与传统车辆的交互作用关系;基于博弈论的思想进行混合交通流中自主车辆换道行为建模.自主车辆之间的换道行为非合作博弈的性质,车辆以自身行驶状态为博弈收益,寻求行驶条件更优的车道.运用SUMO软件对提出的换道行为模型进行了仿真验证分析,仿真结果表明,博弈换道模型相比于传统间隙阈值接受模型具有更高的车道利用率和安
通过对公交运行环境的实际分析,考虑工作日和非工作日的运行特性差异,提出了一种基于天牛须搜索算法的小波神经网络(BAS-WNN)公交到站时间预测模型.该模型利用寻优性能更强的天牛须搜索算法优化WNN的初始参数,使得WNN对时间序列的预测具有更好的性能.最后,利用行车历史数据对神经网络进行训练和建模来实现到站时间的准确预测,将该优化算法与传统的WNN算法和Elman神经网络算法用MATLAB分别仿真测试,对比结果显示,无论工作日还是非工作日,BAS-WNN预测模型对公交到站时间的预测均具有更高的准确性且结果更
文章分析了火灾调查工作的现状,探究了火灾调查工作的优化措施,以期为火灾调查工作的良好开展提供借鉴.发生火灾后,对之进行及时有效的调查,科学分析并准确了解火灾成因,掌握火灾造成的损失情况,有助于快速扑灭火灾,并能为火灾预防提供数据和经验支撑.对此,有必要开展高效良好的火灾调查工作.然而,在火灾调查工作中还存在一些问题,在不同程度上影响了火灾调查的效果,对此,有必要采取有效措施加以优化.
针对传统数控机床故障模式及影响分析(FMEA)中存在专家权重与风险因子权重分配不合理以及风险系数(RPN)计算模型不够稳健的问题,提出一种基于多属性群决策的改进FMEA方法.首先,引入区间数表征机床故障模式风险因子;其次,考虑专家的主、客观权重,根据一致性原则,计算专家综合权重,并利用加权平均算子(WAA)确定故障模式综合评价矩阵;再次,采用区间数熵值法确定风险因子权重,利用改进风险优先数(IRPN)计算模型得到故障模式风险值;最后,结合区间数距离测度,采用最优最劣区间数改进的逼近理想解排序方法(TOPS
考虑电动汽车用户在途随机充电需求,基于随机充电行为及充电排队仿真构建了混合用户平衡模型.在电动汽车不同初始电量状态及市场占有率下,预测了网络平衡交通流和可能充电需求流的变化趋势.利用Frank-Wolfe算法和多标号算法,以Nguyen-Dupius网络为例,设计了电动汽车充电排队仿真的平衡交通流预测模型,本文研究结果可为交通管理者提供科学参考.
研究了基于自动铺丝技术的变刚度复合材料圆柱壳的屈曲性能和缺陷敏感性.基于丝束剪切/重送技术,提出了可以精确模拟圆柱壳面内重叠/间隙区域的简便算法,使有限元模型更加贴近实际制造过程.开展了复合载荷作用下曲线纤维铺层方式对圆柱壳屈曲性能影响的研究,结合Kriging模型和遗传算法,对纤维角度沿环向和轴向线性变化的铺层设计方式进行了优化.最后,利用改进弧长法对不同模态缺陷条件下变刚度复合材料圆柱壳的缺陷敏感性进行了分析.结果 表明:在轴压和均匀外压复合作用下,纤维角度沿轴向变化的铺层方式可以有效提高结构的屈曲性
为提高滚珠丝杠副的定位精度,提出了一种复合载荷作用下考虑滚珠几何误差的双螺母滚珠丝杠副载荷分布模型,分析了在不同轴向载荷和径向载荷复合作用下所有滚珠接触载荷分布状况,在此基础上分析了滚珠几何误差对滚珠动静态接触载荷分布的影响.仿真分析结果表明:本文提出的载荷分布模型对提高滚珠丝杠副的位置精度预测及其定位误差补偿有较好的参考意义.
为充分利用信号的时序相关性特征,增强模型对数据信息的全面挖掘能力,以进一步提高卷积神经网络(CNN)诊断精度,本文将CNN与善于处理数据时序相关性特征的门控循环单元(GRU)相结合,提出了一种新的齿轮箱故障诊断模型.CNN通过端对端的方式提取数据空间特征,并将提取的特征作为GRU的输入进一步提取时空特征,最后将GRU提取的时空特征作为SoftMax的输入进行故障识别.两组齿轮箱实验数据分析结果显示:平均故障诊断精度分别可达99.86%和99.85%,与其它现有模型的结果对比体现了本文模型的有效性和优越性.
为合理预测考虑适用性的大跨桥梁主梁动态可靠性,利用主梁控制监测点的动态极值挠度信息,建立了多维Gaussian Copula技术、多变量贝叶斯动态线性模型(MBDLM)以及一次二阶矩(FOSM)方法相融合地考虑控制点变形失效非线性相关的大跨桥梁主梁体系动态可靠性预测方法.采用某大跨桥梁主梁3个控制监测点的动态监测极值挠度数据进行验证分析,研究表明:考虑适用性的控制监测点变形失效非线性相关的主梁动态可靠性预测值较不考虑控制监测点变形失效非线性相关性所得结果大,说明不考虑失效动态非线性相关性所得结果偏保守.